Pengurus Yayasan Pembangunan Pondok Pesantren Al-Jihad di angkat Oleh Dewan Pembina Pondok Pesantren Al-Jihad, sedangkan pengurus pesantren di bawahnya diangkat dan diberhentikan oleh Pimpinan Pengurus Yayasan. Berikut ini Pengurus Pondok Pesantren :

1. Ketua Umum Yayasan PP Al-Jihad : H. A. M Nasir, S. Sos

2. Sekretaris Yayasan : Syarif Iqbal Fajar Alkadrie, SE

3. Ketua Divisi Pendidikan : Sri Muhadir, S.Pd

4. Ketua Divisi Pengembangan Potensi Ekonomi : Ery Rudiansyah, SP

5. Ketua Divisi Pembangunan : Ery Rudiansyah, SP

6. Ketua Divisi Pengelolaan Aset : Ery Rudiansyah, SP

7. Pengasuhan / Kepondokan : Syarif Iqbal Fajar AlKadrie, SE

8. Kepala Madrasah Tsanawiyah : Sri Muhadir, S.Pd

9. Kepala Madrasah Aliyah : Ridwan

10. Kepala Madrasah Diniyah : Salmiati